微波萃取的基本原理是微波直接與被分離物作用，即微波能直接作用于樣品基體內。當它作用于分子時，促進了分子的轉動運動，分子若此時具有一定的極性，便在微波作用下瞬時極化。

該儀器的使用注意事項：

1、力矩扳手擰緊罐體時，只需聽見第一聲響聲即表示罐體已擰緊，忌重復擰緊；

2、內罐使用前可用5%硝酸或洗潔精溶液浸泡以保持潔凈；

3、罐體可在水中進行冷卻，注意水位線不要越過外罐高度，否則可能污染樣品；

4、實驗完畢開罐時應在通風櫥中完成，由于罐中有溶劑，開罐時應小心緩慢 ；

5、操作前確認罐體外壁無水珠，以免加熱過程中吸收微波能量。